Anh trai Muriel của Alisson cũng là một thủ môn và được phát triển tại Internacional.[82] Gia đình là người gốc Đức, với cha và bà ngoại nói tiếng Đức trôi chảy và khi còn ở Roma, anh được đặt biệt danh là "Người Đức".[83][84] Anh theo Đạo Công giáo.[85] Ngoài tiếng Bồ Đào Nha, Alisson còn nói được tiếng Anh.[86] Vào tháng 5 năm 2019, anh được Tổ chức Y tế Thế giới bổ nhiệm làm đại sứ thiện chí.[87]

Năm 2015, Alisson kết hôn với Natalia Loewe, một bác sĩ đến từ Brasil. Họ có một cô con gái tên Helena, sinh vào tháng 4 năm 2017 và một con trai, Matteo, sinh ngày 14 tháng 6 năm 2019.[88][89]